Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPAA1O43292 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPAA1O43292 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms