Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms