Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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