Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EBAG9O00559 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBAG9O00559 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms