Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms