Protein–RNA interactions for Protein: O00238

BMPR1B, Bone morphogenetic protein receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPR1BO00238 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BMPR1BO00238 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms