Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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