Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E9PBE3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E9PBE3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E9PBE3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E9PBE3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E9PBE3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E9PBE3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E9PBE3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E9PBE3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
E9PBE3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E9PBE3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E9PBE3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E9PBE3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E9PBE3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E9PBE3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E9PBE3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E9PBE3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms