Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SOBPA7XYQ1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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