Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
C9orf92A6NGG3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms