Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RBFOX3A6NFN3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBFOX3A6NFN3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBFOX3A6NFN3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBFOX3A6NFN3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBFOX3A6NFN3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBFOX3A6NFN3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms