Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms