Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms