Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB19A4D1S5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms