Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SEZ6L-204ENST00000402979 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PARD3B-202ENST00000351153 3411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC083805.1-201ENST00000499481 3507 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX11-201ENST00000228264 3717 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 THUMPD3-201ENST00000345094 3961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCY5-210ENST00000491190 3962 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPYL4-201ENST00000420283 4180 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BOC-202ENST00000355385 4278 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012613.2-201ENST00000523176 4533 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-202ENST00000334433 9377 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM108-211ENST00000515826 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 N6AMT1-201ENST00000303775 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF19-203ENST00000578189 5034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CMKLR1-201ENST00000312143 5283 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PLG-202ENST00000308192 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA2-258ENST00000637103 5657 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 POGK-202ENST00000367876 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF1L-201ENST00000242310 6216 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRF3-203ENST00000421160 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB14-208ENST00000615385 3350 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF11-203ENST00000425327 3525 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG1-202ENST00000456916 3860 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SULF2-206ENST00000467815 3905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGA7-206ENST00000553804 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF185-211ENST00000535861 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF473-202ENST00000391821 4715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIGA1-201ENST00000370791 5288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FNBP1L-201ENST00000260506 5341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PBX1-212ENST00000540236 6175 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NEFM-201ENST00000221166 4020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 POLDIP3-201ENST00000252115 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCE1-201ENST00000296577 3921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF526-201ENST00000301215 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PRYP4-201ENST00000306589 444 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 XCR1-201ENST00000309285 5281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A13-201ENST00000311856 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G6-201ENST00000332509 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP63-202ENST00000337090 5632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR219A1-201ENST00000362166 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC32-203ENST00000407242 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV30-201ENST00000417977 447 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA3B-AS1-201ENST00000421735 338 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512326.3-201ENST00000424885 171 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 UTP14A-202ENST00000425117 2403 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC119428.1-201ENST00000429099 383 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF662-204ENST00000440367 4099 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CBLL1-205ENST00000440859 4432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC096637.1-201ENST00000458662 174 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ACOX2-202ENST00000459701 2348 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTDAP-203ENST00000484218 451 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC233724.8-201ENST00000504574 234 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000867.1-201ENST00000511464 255 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC233724.3-201ENST00000512613 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA16-201ENST00000515981 187 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-125P-201ENST00000516752 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms