Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAR-201ENST00000368471 6515 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NFRKB-202ENST00000524746 4114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM39A-201ENST00000319172 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DCTN1-202ENST00000394003 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PMS2-206ENST00000441476 2730 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010547.5-201ENST00000561908 3677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 VIT-203ENST00000389975 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 THNSL1-202ENST00000524413 3788 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SEZ6L2-201ENST00000308713 3801 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL645922.1-201ENST00000456570 3874 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG13-225ENST00000621367 3893 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR31-201ENST00000341761 4862 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC27-204ENST00000368614 6374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA8N-201ENST00000448387 5329 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN25-204ENST00000394152 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF267-201ENST00000300870 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KANK1-206ENST00000382303 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RPAP1-201ENST00000304330 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FLT3-201ENST00000241453 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF3-201ENST00000318837 3842 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NPR3-202ENST00000326958 6380 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV8-61-201ENST00000390283 414 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV6-4-201ENST00000390360 365 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV7-6-201ENST00000390374 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL52-204ENST00000397505 333 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1B1-204ENST00000405198 3838 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL242P-201ENST00000491451 297 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018450.2-201ENST00000492307 368 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPCP17-201ENST00000520330 205 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV3-50-201ENST00000522107 317 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLVI-70-201ENST00000523272 390 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 C1RL-211ENST00000545280 449 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3918-201ENST00000581555 93 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004448.4-211ENST00000582654 485 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4419A-201ENST00000583845 77 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IGFL1P2-201ENST00000593820 330 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMTOR5-AS1-211ENST00000598350 749 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAS3-233ENST00000626960 227 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-B-257ENST00000640094 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP5-201ENST00000390649 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GGA3-201ENST00000537686 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN5A-204ENST00000414099 8303 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA8B-201ENST00000342314 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MED23-204ENST00000368060 4446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF442-201ENST00000242804 6219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SCMH1-205ENST00000372595 3231 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NELL2-204ENST00000437801 3279 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms