Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL762P-201ENST00000469864 289 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DPH3P1-201ENST00000486648 249 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP9-12P-201ENST00000514388 532 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01944-201ENST00000517916 416 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020611.1-201ENST00000537101 254 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SHBG-209ENST00000572182 479 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL138P-201ENST00000577405 287 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007228.1-201ENST00000600036 142 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC233724.14-201ENST00000603531 331 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.159-201ENST00000612585 265 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6876-201ENST00000622618 73 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IPO4-221ENST00000625289 297 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF6-215ENST00000627212 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FBN2-201ENST00000262464 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 HAP1-202ENST00000341193 3880 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ODF2-201ENST00000351030 3899 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EHBP1-201ENST00000263991 5165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIK-214ENST00000488470 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ST8SIA3-201ENST00000324000 11833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRF4-202ENST00000327753 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF3-202ENST00000395358 4092 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIA1-202ENST00000340592 3170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMPD1-203ENST00000539465 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AFF2-205ENST00000370460 13746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRN2-202ENST00000367176 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093802.1-201ENST00000407524 3238 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PPM1K-210ENST00000608933 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SCMH1-207ENST00000372597 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC45B-202ENST00000394570 5638 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 STAT3-211ENST00000585517 3319 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2B2-201ENST00000352432 8593 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 USP54-201ENST00000339859 6247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PCK1-201ENST00000319441 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CLN3-238ENST00000569430 3867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FZD10-AS1-201ENST00000505807 10193 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM5-202ENST00000382011 2402 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 THSD7B-203ENST00000413152 5846 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MED22-208ENST00000610672 4367 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 COL4A4-201ENST00000396625 9895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP12-205ENST00000391775 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TENM2-207ENST00000520394 8034 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRG1-209ENST00000543642 4509 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RRP12-201ENST00000315563 4038 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RHBDF2-201ENST00000313080 3582 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105233.5-202ENST00000642083 4132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIA1-201ENST00000285900 5708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 APH1B-201ENST00000261879 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RRP12-203ENST00000414986 4242 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF322-201ENST00000415922 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED1-204ENST00000375772 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SPECC1-201ENST00000261503 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC040162.3-201ENST00000572067 3907 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010478.1-201ENST00000601500 6762 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms