Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSRB1Q9NZV6 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSRB1Q9NZV6 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms