Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AOX2P-204ENST00000487742 3284 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR161-210ENST00000546300 7388 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LCN1-201ENST00000263598 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TNNT3-202ENST00000344578 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP174-201ENST00000362702 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TNNT3-205ENST00000381563 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR25-201ENST00000384816 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA77.1-201ENST00000408156 125 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136309.3-201ENST00000427591 266 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3CG-202ENST00000440650 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CRIP1P4-201ENST00000442565 229 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MT1JP-201ENST00000444023 186 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ACA64.3-201ENST00000459613 127 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL337P-201ENST00000462468 301 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL698P-201ENST00000480095 302 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP414-201ENST00000516580 136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3972-201ENST00000582732 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.101-201ENST00000611704 303 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL185P-201ENST00000615150 249 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL673P-201ENST00000616262 237 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL495P-201ENST00000616925 237 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL719P-201ENST00000620196 237 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL469P-201ENST00000621501 237 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073592.9-201ENST00000624885 371 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PKP4-218ENST00000629219 162 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ABBA01040607.1-201ENST00000640749 321 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NEK1-206ENST00000510533 5377 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMIZ2-201ENST00000265346 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 COG1-210ENST00000618996 3369 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP1-206ENST00000571629 3105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC084759.3-201ENST00000624468 3944 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359075.2-201ENST00000354921 4998 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-225ENST00000480911 6811 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BCOR-212ENST00000615339 2618 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CALML3-AS1-202ENST00000543008 4531 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DCLK3-201ENST00000416516 5344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PNMA8C-201ENST00000617053 4255 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GFM1-201ENST00000264263 3453 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGBL1-205ENST00000545560 4808 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 IL4R-203ENST00000543915 3539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV3-211ENST00000616411 5742 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 OPCML-207ENST00000541867 6277 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 OPCML-208ENST00000612177 6250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRA5-201ENST00000335625 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMIZ2-205ENST00000433667 3800 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020915.6-201ENST00000637233 3042 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 C2orf49-201ENST00000258457 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF623-202ENST00000501748 6759 ntAPPRIS P3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01159-201ENST00000433433 3103 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100788.2-201ENST00000625199 2889 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms