Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RPL10P19-201ENST00000519013 301 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD11P31277 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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