Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AUP1Q9Y679 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms