Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms