Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms