Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms