Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MLH3Q9UHC1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms