Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHPF2Q9P2E5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms