Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms