Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms