Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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HOXC10Q9NYD6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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HOXC10Q9NYD6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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HOXC10Q9NYD6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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HOXC10Q9NYD6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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HOXC10Q9NYD6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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HOXC10Q9NYD6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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HOXC10Q9NYD6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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HOXC10Q9NYD6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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HOXC10Q9NYD6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC10Q9NYD6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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