Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms