Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINM1Q9NU53 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms