Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP7BPQ9NSQ0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms