Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX15Q9NRS6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms