Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD3Q9NPG1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms