Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB9BQ9NP90 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RAB9BQ9NP90 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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