Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSU72Q9NP77 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms