Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EHD4Q9H223 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms