Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC90BQ9GZT6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms