Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms