Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms