Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FYCO1Q9BQS8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FYCO1Q9BQS8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms