Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HINFPQ9BQA5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms