Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOPXQ9BPY8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms