Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms