Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RAB40CQ96S21 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB40CQ96S21 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB40CQ96S21 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB40CQ96S21 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40CQ96S21 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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