Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2Q96Q42 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms