Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL4Q96JN8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms