Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SGF29Q96ES7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGF29Q96ES7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGF29Q96ES7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGF29Q96ES7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGF29Q96ES7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SGF29Q96ES7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms