Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMD3Q96D46 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms