Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP4Q969X6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms